Častou příčinou operace je zdravotní potřeba odstranění konečníku nebo části tlustého střeva před konečníkem. Dalším důvodem je odlehčení střevu při chronickém zánětu sliznice konečníku.
Další důvody pro operaci: vrozené vývojové vady tlustého střeva (atrézie, stenóza tračníku nebo Hirschsprungova choroba), záněty střeva (Crohnova choroba, ulcerózní kolitida, divertikulitida, ischemická kolitida), nádorová onemocnění, ileózní stavy (ileus strangulační, cévní, mechanický), následky ozáření, úrazy (střelné, bodné) a náhlé příhody břišní, poškození střeva při operaci nebo invazivních vyšetřovacích metodách, amputace rekta i anu z důvodu nádoru nebo chronického zánětu s poškozením svěračů, inkontinence stolice nebo endometrióza.